Neue methodische Ansätze zur Strukturuntersuchung der Loops des Membranproteins Bacteriorhodopsin

Röntgendiffraktion mit ortsspezifisch gebundenen Schweratomen und anomale Dispersion an der Schwefel K-Kante

Behrens, Wolfgang


Proteine steuern und regeln eine Vielzahl von Vorgängen in der belebten Natur. Dabei unterscheiden sich Proteine durch ihre unterschiedliche Struktur und Funktion. Die Kennntnis der Beziehung zwischen Struktur und Funktion ist daher wesentlich für das Verständnis der biophysikalischen Vorgänge.
Eine wichtige Klasse von Proteinen bilden die sogenannten G-Protein gekoppelten Rezeptoren. Diese Proteine sind an der Weiterleitung von Signalen beteiligt. Das in dieser Arbeit untersuchte Membranprotein Bacteriorhodopsin kann als Prototyp dieser Klasse aufgefaßt werden. Bacteriorhodopsin ist ein bakterielles Membranprotein, das Lichtenergie nutzt, um einen elektrochemischen Protonengradienten über der Zellmembran aufzubauen. Die dreidimensionale Kristallisation von Membranproteinen gestaltet sich aber wegen ausgeprägter hydrophober und hydrophiler Bereiche in der Sekundärstruktur sehr schwierig, während zweidimensionale kristalline Strukturen leichter zu erzeugen sind.
In der vorliegenden Arbeit zeigt der Autor Methoden auf, mit denen auch an zweidimensionalen Kristallen Strukturinfomationen über Positionen einzelner Aminosäuren gewonnen werden können. Dabei kommt zunächst die Methode des isomorphen Ersatzes (SIR) zum Einsatz, bei der relevante Stellen im Protein mit Schweratomen markiert werden. Es wird gezeigt, daß auch Strukturänderungen, die während der Aktivierung im Protein auftreten, sich mit Hilfe dieser Methode beobachten lassen.
Mit der Methode der anomalen Diffraktion (MAD) unter Einsatz von Synchrotonstrahlung zeigt der Autor, daß auch Schwefelatome als Marker für Strukturuntersuchungen verwendbar sind und stellt dazu Röntgendiffraktionsexperimente vor. Der Vorteil dieser Methode liegt u.a. darin begründet, daß alle Messungen an ein und demselben markierten Präparat vorgenommen werden können und somit keine Referenzprobe nötig ist.


Inhalt:

Einführung
  1. Struktur und Funktion von BR
    1. Proteine als wichtige Bausteine der belebten Materie
      1. Struktur von Bacteriorhodopsin
      2. Funktion von Bacteriorhodopsin
    2. Rhodopsin als ein wichtiges Retinalprotein
    3. Zielsetzung
  2. Grundlagen
    1. Einführung
    2. Wechselwirkung elektromagnetischer Strahlung mit Materie
    3. Effekt der anomalen Dispersion auf Bragg-Reflexe
    4. Abschätzung des anomalen Effektes
    5. Die Fourier-Differenzmethode
    6. Refinement
    7. Charakterisierung der Proben
  3. Lokalisierung von Schweratomlabel mittels Röntgendiffraktion
    1. Einführung
    2. Methode
      1. Aufbau des Experimentes
      2. Probenwahl
    3. Durchführung der Messungen
      1. Kontrolle der Spektren
      2. Probenpräparation
    4. Die Probe A103C
      1. Datenreduktion und Datenanalyse
      2. Refinement der Labelposition
      3. Modellrechnung
      4. Molekulardynamische Modellrechnungen
      5. Diskussion
    5. Die Probe D96A/V101C-MB
      1. Diskussion
    6. Die Probe V130C-MB
      1. Ergebnisse und Diskussion
  4. Strukturuntersuchungen mittels anomaler Dispersion
    1. Diffraktionsmessungen im weichen Röntgenbereich
    2. Das Diffraktometer
    3. Zielsetzung und Probenwahl
    4. Messungen an der Jod-LIII-Kante
    5. Messungen an der K-Kante des Schwefels
      1. Durchführung der Wildtyp-Messungen
      2. Probenpräparation
      3. Pobenhalterung und -kühlung
      4. Wellenlängenmonitor
    6. Auswertung der Messungen zur anomalen Dispersion
    7. Fehlerbetrachtung
    8. Ergebnisse und Diskussion
      1. Wildtyp-Messung
      2. Ergebnisse der Messung an der Mutante Q105C
  5. Strukturänderungen im M-Intermediat
    1. Einführung
    2. Material und Methode
      1. Probenpräparation
      2. Aufbau des Experiments und Durchführung der Messung
      3. Auswertung und Diskussion
  6. Zusammenfassung
Literaturverzeichnis




home - Zur Startseite des VWB - Verlag Wissenschaft und Bildung


Hiermit bestelle ich / I like to order:
Stück/copy "Neue methodische Ansaetze ..."

Meine EMail:

Meine Adresse / My address:

Zahlungsart/Method of payment:

per Kreditcarte (Visa Card only)

Rechnung (im Ausland Vorausrechnung)/Payment in Advance

BITTE SENDEN SIE UNS NACHFOLGENDE DATEN AUS SICHERHEITSGRÜNDEN NUR PER POST ODER FAX:
PLEASE SEND THE FOLLOWING ITEMS ONLY BY POST OR FAX:
Fax No: +49-[0]30-251 11 36
Kreditkartennummer/Card Number
Gültig bis/Valid until: - Kreditkartenprüfnummer/Card Verification Code/Value:

Einzugsermächtigung (nur Inland)
Kontonummer Bankleitzahl
Name des Kontoinhabers

Datum + Unterschrift / Date + Signature:


Was Sie uns sonst noch sagen wollten: